Σαρωτικούς ελέγχους πραγματοποίησαν το προηγούμενο διάστημα οι Ευρωπαίοι αξιωματούχοι για τον τρόπο πιστοποίησης και πληρωμής των βιοκαλλιεργητών, με τους ιθύνοντες της DG Agri να μένουν απόλυτα ικανοποιημένοι από την πρόοδο της Ελλάδας.
Μάλιστα, πολύ καλή εντύπωση προκάλεσε στους Ευρωπαίους η οριστική κατάργηση βιολογικής κτηνοτροφίας και μελισσοκομίας, καθώς είχαν εντοπιστεί παρατυπίες και παραλείψεις, ενώ σύμφωνα με όσα διαρρέουν από το Υπουργείο χιλιάδες παραγωγοί αποχώρησαν κατά τη δεύτερη φάση των ελέγχων. Εξάλλου, από αυτά τα δυο προγράμματα περίσσεψαν 80 εκατομμύρια ευρώ, τα οποία θα δοθούν για μικρά αρδευτικά έργα, με τους αγρότες να αντιδρούν, λέγοντας ότι το ΥΠΑΑΤ κάνει πολιτική με τα δικά τους χρήματα.
Σε σχέση με τους ελέγχους πηγές της DG Agri λένε ότι οι έλεγχοι έγιναν σε όλη την πυραμίδα, από το Εθνικό Σύστημα Διαπίστευσης, έως και το ΥΠΑΑΤ και την ΑΑΔΕ η οποία κάνει πλέον τις πληρωμές και μάλιστα σύμφωνα με σχετικό δημοσίευμα του agronews.gr έγινε επίβλεψη μέχρι και στον νέο τρόπο λειτουργίας του ΕΛΓΟ – «Δήμητρα». Το βασικό που σημειώνουν οι Ευρωπαίοι αξιωματούχοι είναι ότι πλέον πληρώνονται περισσότεροι πραγματικοί παραγωγοί και καλλιεργητές βιολογικών, καθώς το νέο σύστημα πιστώσεων είναι πιο αξιόπιστο λόγω των διασταυρωτικών ελέγχων.
Στο ΥΠΑΑΤ έχει συσταθεί ειδική ομάδα η οποία έχει ως βασικό καθήκον να αλλάξει όλο το πλαίσιο πιστοποίησης, ελέγχων, αλλά και πληρωμής όσων δηλώνουν συμμετοχή στα Βιολογικά, ενώ η σκέψη για πλήρη κατάργησή τους με ταυτόχρονη ενσωμάτωσή τους στα Οικολογικά Σχήματα είναι ακόμα ενεργή. Ωστόσο εάν γίνει κάτι τέτοιο δεν είναι βέβαιο πως μπορούν να μεταφερθούν κονδύλια από τις Αγροπεριβαλλοντικές Δράσεις στα Eco – Schemes, επομένως οι ιθύνοντες του Υπουργείου ψάχνουν τη «χρυσή τομή».